就是七八年之久。直到一个月前听海瑞揭发了于厨师的身份，才真相大白。急忙六百里加急，将前因后果向严嵩汇报清楚，严嵩的回信也是在围城之后才送到洪飞的手上，让洪飞与海瑞共同审理。
洪飞将邸报交给海瑞，海瑞见抵报中说明洪飞的身份是工部员外郎，让洪飞与海瑞共同审理此案。洪飞是严嵩之子严世蕃的手下，当然也是严府的心腑。海瑞只得按朝廷的要求办理。
两天后，在淳安县大堂之上，海瑞开始审何耀宗。李时珍和洪飞在一旁陪审，王教头和管家等人则夹杂在百姓之中。
一声惊堂木，何耀宗被压了上来，手脚带着铁潦，跪在大堂中。
海瑞当堂将何耀宗回淳安、毒杀潘天麒和下瘟疫的罪行当众宣布，然后问何耀宗：“本官刚才所说可有差错？”
“没有，我很佩服你，竟然将来龙去脉调查的这么清楚，就像亲眼所见一样，就是这样，没什么可说的。”
“好，既如此，还有几个问题要问你？当你回到淳安，看到父亲的笔记之后，应该知道你的父亲何孟荣大夫并非因潘天麒漫骂而亡，为什么还要下毒杀他全家呢？”
“家母去逝的早，是我父亲含辛茹苦把我一手带大的，这里面的艰辛不是几句话能说清楚的。所以我发愤学习，成了名医，从全天下最有名的千百名医生中出颖而出，选拔到太医院，授八品官职。我本想著书立作，成为张仲景，孙思邈那样的人物，为我父亲，为世代行医的祖上争光。没想到，潘天麒那狗贼因为自己儿子有先天疾病，竟然把责任赖在家父的头上，在官府定案之后，仍然雇了十几个人上我家中漫骂。让家父颜面何存？在他们如此羞辱之下，谁敢说我父亲在试药的过程中能心平气静，没受一丝一毫的影响？所以潘天麒这狗贼就是我的杀父仇人，我也要让他知道中毒的感受，而且要百倍千倍地返还，只是时间还是短了，我还有好些手段没有使出来，实在有些可惜。”
“你府中秘室酒缸中的骷髅是谁？”
“嘿嘿，那是我的得意之作。当年就是这个地痞拿了潘天麒几个臭钱，领着一伙人来到我家对家父辱骂，还砸坏不少东西。我回到淳安查访到此人，将他迷倒弄到秘室之中，被我百般折磨，用尽所有手段，只留下一副骷髅泡在酒缸，方解我心头之气。我想他一定后悔来到这个世上，这是他要付出的代价！”这几句话在让在场所有人都不寒而栗。
“休找借口，若说复仇，你将潘天麒一家和那地痞毒死也算复了仇。可是你为了李太医那本医书，竟然想毒死李太医，一计不成又想毒死我和全城百姓。你要不这么做，还真不一定能抓到你。现在还在以复仇为借口，可笑至极。”
“事已至此，还有什么可说的。有你二人在，我永无出头之日，没有办法，只能让全城的人都为你俩陪葬。”
“我问你，那带瘟疫的衣服从哪弄来的？”
“这有何难，从疫区弄来的，只要有钱，别说染了瘟疫的衣服，就是那得了瘟疫的尸体也给能你给弄几百来。”
“你还有什么说的？”
“还能有什么可说的？我也曾是一代名医，也曾想名扬天下，流芳百世，只是运气不好，时也，命也！我有一个请求，这些年来，我对毒物、毒药的训养配制提练之法颇有心得，失传实在可惜。如能给我一年时间，将之整理成册，死也瞑目。”
海瑞冷笑道：“医者仁心，当悬壶济世，救百姓疾苦。即使没有神农尝百草的精神，也不能以人命为代价去辜名钓誉，你不是名医，而是恶魔。害人之术，留之何用？不是你运气不好，是你心肠太歹毒。为了名誉不择手段。你父亲怎么会有你这么一个恶毒的儿子！来吧，签字划押。”
划押完毕，海瑞宣判：“按《大明律》：杀一家非死罪三人即判凌迟，你说你杀了多少人？潘天麒一家四口，地痞一人，还有瘟疫