必须集中起来，对已死亡的尸体要进行焚烧，只有一事，如果有些已患瘟疫的人呈疯癫之状，不让医治，比如商贾大户、朝廷命官等，在下可否行非常手段，强行处治。”
“何大夫果有良策！本官这就放心了，对那些不听从安排之人，当然可以强制，不管他是谁，也不论他是什么职务。哪怕是知县本人，得了瘟疫不听从安排也一样。非常时期得用非常手段！这是舍小保大之举，何大夫可放心处置，不可拘泥于小节。”
何耀宗心中大喜，率领两百名士兵，带好配制的药剂，用毛巾护好口鼻直奔淳安县而来，快到淳安县县城，何耀宗叫停队伍大声道：“各位，淳安县瘟疫十分厉害。进城之后，淳安之人只有病与不病之分，无官民富贵之别，是否患病由我来判定，所有士兵进城之后必须严格听从我的命令。对患病之人不论身份都要集中起来，由我医治，不得有误。”众士兵齐声答应。何耀宗很满意，带队来到淳安城下，城门虚掩，一推即开。来到城中，一片死寂，面前的街道上空无一人。
“快、先到县衙救治。”说着，带队向县衙奔来，何耀宗的计划很周密：进了城中，找到海瑞和李时珍等人，不由分说，以救治为名立即关押起来，至于到底是救治还是下毒，完全由自己说了算。一场疫情下来，多死几个人，谁又会那么认真计算，对外只说是让其自生自灭，实际上毒杀易如反掌，而得疫之人，谁敢去检验呢？再说还那么多！对于因瘟疫而死的尸体，又有哪个仵作和医生愿意去分辩到底是毒死还是病死的，最后一把火烧了县衙。只要海瑞、李时珍等人一死，自己还可以重出江湖，扬名立万。不然到处是海捕文书，寸步难行，这一世难道要隐藏在荒山野林之中，苦度一生吗？所以是胜是负在此一搏！
眼看到了县衙，何耀宗大喊一声：“包围县衙，将其中所有人员都集中起来，我要一一验看。”命令下去，确是无人执行，何耀宗回头望着这些士兵，都站立不动。“我说的话，你们没有听到吗？”
“他们当然听到了！”海瑞推开县衙的门走了出来，“不过他们只听我的命令，是来帮助我做疫后恢复的，顺道将元凶巨恶绳之以法，又怎么会听你的命令呢？”何耀宗听了这话，知道自己中了计，转身想逃，却哪里能逃的了，被几名士兵按在地上，用绳子捆了个结结实实。
原来海瑞几天前写了一封给知府的密信，将城中瘟疫情况进行了说明，讲清瘟疫已被彻底控制。同时为了抓住何耀宗，利用他痴迷名声，不甘老死山林的心理，设了这个局。引何耀宗自己上钩。何耀宗面如死灰，士兵从其怀中搜出被抢走的笔记交还给李时珍，然后将其押入大牢严加看管。
海瑞准备两天后公审何耀宗，当天的晚上，有一人求见海瑞。来的不是别人，正是洪教头。此人姓洪，名飞，是严嵩的心腹，被派来找回秘信。
洪飞从京师来到淳安，本来的计划是先暗中查找，如果找不到，就明着抢，带领杀手杀入府中，将潘天麒一家全都杀掉，然后一把大火将整个山庄烧他个干干净净，片瓦不留，那秘信也自然再也不会被发现。可是暗中查找几次也没有结果，正准备带领杀手灭户烧庄。
就在这时，何耀宗在庄中出现了，洪飞大吃一惊，何太医曾到严府给严嵩看过病。当时洪飞就在一旁，所以认得他，此时这个何太医忽然来到淳安隐姓埋名，来给潘天麒看病，难道皇上也怀疑曾铣的案子有冤情，派这个太医来寻找证据？
如此一来，便不能灭户烧庄了，那样只会让皇上更加怀疑，洪飞立即向严嵩说明情况，请示计划。嘉靖皇上的性格，严嵩最了解，听了洪飞的秘报，严嵩也谨慎起来，决定让洪飞不要轻易动手杀潘天麒，而要继续隐藏下去，一方面观察何太医的目的。第二个也是最重要的绝不能让何太医得到那封信。
这么一来，洪飞在潘天麒的庄上一呆