老儿打败，要不是他轩辕老儿使用卑鄙的手段，他能打败我？我呢当然是被轩辕老儿封印在浙大，至于轩辕老儿是怎么到这里，嘎嘎，这并不是什么光彩的事情，让他自己告诉你吧。”
于是黄帝便将他两个人大战的真相告诉了宗叶。原来原来黄帝和蚩尤并不是并不是这片大地上的居民，黄帝来自天神一族，是人族三老，三皇之一的人皇，而蚩尤是魔族，魔皇之弟。二人则是天地初出现的一缕玄黄之气所化，蚩尤是玄气所化，而黄帝则为黄气所化。两人既相生相克，又互为补充。而两人如果不幸的是两人分别转生在魔族和天神族。由于本质上的相生相克，两人则一见面就是大打出手，矛盾越来越激烈，又由于二人在神魔两族身居高位，甚至有引发神魔两族大战的趋势。
魔皇和神皇为了两族来之不易的和平，于是便分别封印了两人的修为，将两人发配到了这方大地。希望二人能够反思一下自己，可以认识到自己的错误，到时候那么到时候他们则可以返回各自的种族。可是没想到的事情是两人到了地球上还是争斗不断。黄帝由于从神族带来了许多有利于人民发展的知识，所以黄帝被人类推举成为了部落联盟首领。
而蚩尤则是降服了八十一个怪物，传他们修炼之法，他们逐渐强大，这便是后来的八十一兄弟，并组建强大的军队。二人之间不断征战，最终两人在涿鹿发生了最后的大决战。蚩尤有八十一兄弟，又有着炼器的优势，同时还熟知兵法。一开始打的黄帝没有招架之力。
最后黄帝不得不向天界求助，神族在接到皇帝的求助后，派下了天神九天玄女来帮忙，并且带来了三老之一的太上老君给黄帝锻造的一柄剑，也就是后世人所说的轩辕剑，此剑锋利无比，可以割裂蚩尤魔体。
在九天玄女的帮助之下，蚩尤不是对手，最终战败。可是蚩尤魔体有一个特点，一旦修炼成便只不死不灭，所以黄帝没办法彻底杀死蚩尤，最后只能用轩辕剑将他的身体分裂，分别镇压在五个地方。
而蚩尤的魔魂由于是玄黄之气所化，轩辕剑也拿他没办法。这时神族派下人来告诉了黄帝一个办法，那就是带着蚩尤的神魂去一个地方，那个地方已经一由天皇伏羲和地皇神农共同布下了噬魂大阵，黄帝可以将蚩尤的神魂封印在此大之内，由大阵来慢慢的磨灭蚩尤的神魂。
而就在黄帝持大阵将蚩尤的神魂封印之后，由于消耗过大十分的虚弱。这是他在人间的收的义子轩辕无情，趁着他虚弱，盗取了轩辕剑，并用轩辕剑毁掉了黄帝的肉体，将他的神魂也打入了噬魂大阵，并将之封印。而封印他们神魂的地方，由于当年神农经常出现在这儿。所以后世人们就把此地叫做为神农架。
而轩辕无情在封印了蚩尤和黄帝的神魂之后，知道自己的功力与黄帝相比相差太远。可能无法镇住人族中强者。于是他就想了一个办法，那就是打着黄帝的旗号。搜罗天下各种具有奇特体质的女子，女子双修来提升自己的功力。于是后世便有了黄帝御女三千然后得道成仙的传说。
蚩尤在被封印到噬魂大阵后才明白自己肯定是被出卖了，要不然凭神界是不会知道噬魂大阵的。二人在噬魂大阵中开始的时候还相互争斗，但是后来他们都想明白了。只有二人齐心协力才能够在中活下去。于是二人又停止了争斗。同时又由于二人是天地之初玄皇之躯所化，本是同源，所以二人在一起修炼的时候，互为补充。神魂不仅没有被磨灭，而反而经历了这么多年。二人的神魂更加凝实了。
其实以二人的实力完全可以挣脱噬魂大阵到外面去。但是由于二人没有肉体。一旦二人出现到外界就会被大道发现，从而降下大道雷罚，如果有肉体的话，他们是浑然不惧大道雷罚的，但是现在他们没有肉体，是没有办法扛过雷罚的。所以他们选择了继