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按照唐律，汉王李元昌应判死罪。
李世民向众臣求情道：“汉王是我的亲弟弟，年少无知才犯下这等错误，我想饶他一命，你们觉得如何？”
长孙无忌说道：“陛下，天子无私家，您不能因为爱惜自己的弟弟，就乱了国家法度。”
房玄龄补充道：“陛下，您的一言一行都是天下人的表率，今天如果您饶了汉王，那么以后其他亲王再犯罪，您又该如何处置呢？”
魏征也郑重其事的说道：“汉王触犯法律，就必须得到相应的处罚，如果陛下特赦其罪，那就会让老百姓觉得，皇家子弟可以凌驾于法律之上。
您这是自绝于民的行为，离亡国就不远了。”
李世民无奈的说道：“唉，你们这是逼我背上残杀亲弟的恶名啊。”
魏征说道：“陛下，您能够大公无私，大义灭亲，维护法律的公正和公信力，这是千古传诵的美名，怎么会是恶名呢？”
于是李世民只能赐汉王自尽，至于他的母亲妻妾儿女，李世民下诏特赦，不予追究连带责任。
至于侯君集，李世民是真心不想让他死，甚至都低声下气的和大臣们商量，历数他对国家的功劳，就想让大臣们饶他不死，哪怕充军流放西域戍边也行。
李靖说道：“陛下，当初臣曾提醒过您，侯君集有反心，但是您爱惜他的才华，不忍放弃他，可是又不对他加以约束，
终于导致他矜功自伐，恃宠而骄，闯下杀身之祸，臣认为陛下也负有连带责任，所以侯君集断然不能特赦。”
江夏王李道宗也说道：“侯君集这个人志大才疏，目中无人，自以为为国家流过血立过功，就徇私枉法，树立朋党。
陛下您虽然任命他为吏部尚书，但是他仍然不知满足，认为自己应该得到太尉一职，而耻于在长孙仆射，房中书之下。
像这种贪得无厌，不知感恩之徒，臣等认为，绝不可轻言特赦，以便警醒其他功勋贵戚，安分守己，低调做人。”
看到满朝文武都坚决反对特赦侯君集，李世民也不能一意孤行，他只好派人给侯君集送去一壶酒，让他自行了断。
侯君集跪在地上痛哭不止，临死前向皇帝求情说：“自从陛下起兵以来，臣就鞍前马后侍奉左右，现在犯罪受罚，死而无怨，只求陛下能给臣李泰下一个儿子，不知足让侯氏绝祀。”
按说侯君集是应该被满门抄斩的，不过李世民也不是铁石心肠。
主犯严惩，协从不问，这样也就行了。于是便宽恕了侯君集的老婆孩子，把他们流放到岭南，给他们一次从新开始的机会。